2007年4月27～28日，“《新疆通史》编委会第二次全体会议”在乌鲁木齐昆仑宾馆召开。自治区党委副书记杨刚到会并作了重要讲话。自治区政协副主席、编委会主任吴敦夫主持了会议，与会者有编委会副主任吴福环、苗普生（专职），编委会委员、各分卷主编、自治区社科规划办主任郭武斌以及编委会办公室的同志。

    根据编委会的安排,本次会议主要讨论两项议题：即（1）向各位编委汇报两年来编委会的工作及2007年度编委会的工作计划；（2）讨论并通过主体工程各卷的编写大纲。在以上两项议题中，完成《新疆通史》编写大纲的修订工作是这次会议的主题。为此，编委会办公室做了大量的准备工作。

    杨刚指出，新疆地处祖国西北边陲，地域辽阔，民族众多，有着极为悠久的历史和璀璨夺目的文化遗产。近代以来，随着新疆历史研究的深入和大量文物的出土，其古老的历史逐渐显现出来，其影响日益扩大。新疆历史研究在维护祖国统一、反对民族分裂，抵御国内外反华势力分化、西化我国图谋方面有着极为重要的现实意义。近几年来，江泽民同志、胡锦涛同志等中央和国家领导人视察新疆期间曾多次就新疆历史问题发表重要讲话，充分说明了新疆历史研究在传承文明、资政育人、丰富完善祖国传统历史文化内容方面具有不可替代的重要作用。所以，编写一部资料详实、论证严谨、结论正确的《新疆通史》，对于正确阐明新疆历史，包括各民族的发展史和宗教演变史，对推进新疆文化建设，以及促进三个文明建设都具有重要意义。

    杨刚说，《新疆通史》的编撰工作从一开始就受到自治区党委、政府和中宣部、国家社科规划办的关心和支持，中共中央政治局委员、自治区党委书记王乐泉同志对《新疆通史》的编撰工作多次给予了重要指示。中共中央政治局委员、中宣部部长刘云山同志亲自批准《新疆通史》为国家社科基金重大项目，关心《新疆通史》的编撰工作。《新疆通史》编委会成立两年以来，正是按照王乐泉同志、刘云山同志等领导的指示精神，周密计划，辛勤工作，敬业奉献，成绩是显著的。自治区党委、政府对编委会是信任的，对编委会的工作是满意的。

    为了保证编撰的《新疆通史》的高起点、高质量和高水平，经得起时间和学术界的考验，杨刚特别强调，编委会要以马克思主义理论为指导，坚持科学的理论和方法，以史实为依据，科学地探索和正确地阐明新疆历史上的重大事件和理论问题；同时，他指出，爱国主义是新疆历史的主线，因此在写作过程中一定要坚持爱国主义，坚持民族团结，要充分认识和把握国家统一、民族团结始终是新疆历史发展的主流，中华民族多元一体格局是历史地形成的，各民族都做出了自己的贡献等基本观点；他认为《新疆通史》的编撰工作一定要体现突出新疆特色，所以要全面真实地反映新疆各民族历史发展的进程。杨刚希望通过编写《新疆通史》不仅出一批高水平、高质量的学术成果，同时还要锻炼科研队伍，培养出一批科研人才。

    最后，杨刚表示，自治区党委、政府将全力支持《新疆通史》的编撰工作，在资金使用上将予以充分保障，并为大家创造一个良好的宽松环境。

    吴敦夫向与会者介绍了《新疆通史》编委会自第一次全委会以来的主要工作，并部署了编委会2007年度的工作。在讲话中，吴敦夫特别强调了大纲修改工作的重要性，希望通过这次会议，能够讨论并通过各卷编写大纲的基本框架结构，从而为正文的编写铺平道路（发言另发）。

    会议共进行了两天。27日下午、28日上午进行分组讨论，各位编委知无不言，言无不尽，纷纷对各卷的编写大纲提出了各自的修改意见和建议。28日下午，小组讨论主持人周伟洲、华涛简单概括了各组的发言。编委金冲及、马大正也分别从整体框架、具体问题的处理、项目的组织工作等不同角度提出了指导性的意见和建议。

    之后，吴敦夫总结了本次会议，他认为这次编委会有五大特点，即会议准备充分、编委认真负责、会议学术气氛民主活跃、意见发人深省、建议催人奋进。同时，吴敦夫还指出了会议筹备方面的不足之处，希望编委会办公室在今后的工作中不断改进。

    会议结束前，吴敦夫代表编委会就近期工作向各位主编提了几点要求：

    第一，希望各卷主编认真对待各位编委的意见和建议。

    第二，各卷主编应当遵守编委会的各项规定。

    第三，各卷主编必须保证有相当精力用于《新疆通史》的编写工作。

    此次会议进行得热烈而紧凑，全体编委基本通过了各卷的编写大纲，为《新疆通史》编撰工作的顺利进行奠定了基础。