新疆社会科学院哲学研究所其前身是新疆社会科学院马列主义与毛泽东思想研究所。研究所重点研究马克思主义哲学、中国哲学；同时，深入研究新疆地区文化发展、文化润疆理论与实践等问题。
　　2017年以来，哲学研究所科研人员主持的国家社会科学基金项目有6项，其中包括国家社科基金重大项目1项；自治区社会科学基金项目6项，其中包括自治区社科基金重点项目2项，自治区社科基金一般项目3项，自治区社科基金青年项目1项；在核心刊物发表论文多篇；编写《新疆文化发展报告》等多部著作。
　　未来，哲学研究所将把马克思主义哲学和中国哲学建设成为成熟的哲学理论与应用研究的综合性学科；着力培养学术骨干，引进哲学研究后备力量，打造一支结构日趋优化、实力逐步增强的科研队伍。
　　副所长：周丽。